גני עגנון הוקמו מתוך חזון להביא בשורה ואיכות בתחום החינוך לגיל הרך, בסטנדרטים מוקפדים ומושקעים בכל פרמטר שטרם נראו בירושלים ובכלל, הן מבחינה חינוכית ופדגוגית והן מבחינת התנאים הפיסיים של הגן, ומתוך ראייה מכבדת הן של הילדים בגן, הן של הוריהם והן של הצוות החינוכי.

לצורך כך הושקעו מיטב האנשים ומיטב המוחות בתחום החינוך, הבטיחות, התזונה והניהול:

צוות ניהולי רחב, של מייסדי הגן יחד עם המנחה הפדגוגית ד"ר תמר אשר, והגב' עפרה מאור מנהלת הגן, עמלו על מנת לבחור בקפידה רבה את הצוות החינוכי הטוב ביותר. צוות שכולל גננות מוסמכות ונשות חינוך בעלות ניסיון מוכח והמלצות. הצוות מקבל הדרכה פדגוגית על בסיס יומיומי, כולל פגישות שבועיות סדירות ופעילויות חינוכיות המאפשרות לפתח ולהעמיק את הראיה החינוכית ולהעשיר את התפתחות הילדים בגן.  אנו שואפים ליצור אווירה טובה ומשפחתית בגן, וזאת על ידי שמירה על תנאי העסקה הולמים ומתגמלים לצוות, כולל ימי גיבוש, פעילויות צוותיות ואירועים שהצוות נהנה מהם לאורך השנה.

הגן נבנה על פי כל תקני הבטיחות, ובעיצוב מוקפד במיוחד, בדומה לגנים באירופה ובארה"ב  עם מרחב רב בכל כיתה, אור טבעי, עץ , בדים רכים וצבעים עדינים ונעימים . האסתטיקה המוקפדת היא לא רק לשם יופי. יש חשיבות רבה לבחירת הצבעים והחומרים מהם נבנה הגן, אשר משפיעה על התפתחות הילדים ונותנת להם את האווירה הנכונה, המרחב והרוגע על מנת להרגיש רגועים ונינוחים לחקור את סביבתם בבטחה, במרחב שמותאם להם, מכבד אותם באופן אישי ומונגש עבורם.

ההקפדה על הבטיחות בגן מעל הכל. כל דבר אשר עשוי להגיע לידי הילדים מותאם לצרכיהם. רק כך יוכלו לפתח ולמצות את היכולות שלהם, הן מבחינה פיסית והן מבחינה מנטלית ורגשית.

כל ילד הוא עולם ומלואו ולנו חשוב לתת מענה ותשומת לב אישית לכל אחד ואחת, משכך אנו מקפידים על צוות רב ויחס חניכה גבוה בין צוות וילדים בכל כיתה בגן.

ההשקעה ותשומת הלב לכל פרט ופרט, גדול עד קטן, מצויים בגן בכל דבר ודבר. ההקפדה וההשקעה גם בפרטים הקטנים,  הם אלו שעושים את "גני עגנון" למה שהם.